原实行免抵退税办法的转登记纳税人在一般纳税人期间出口货物劳务、服务，尚未申报抵扣的进项税额以及转登记日当期的期末留抵税额，计入“应交税费一待抵扣进项税额” ,并参与免抵退税计算。

上述尚未申报抵扣的进项税额应符合国家税务总局公告2018年第18号第四条第二款的规定，即:转登记日当期尚未取得的增值税专用发票、机动车销售统一发票、收费公路通行费增值税电子普通发票，转登记纳税人在取得上述发票以后，应当持税控设备，由主管税务机关通过增值税发票选择确认平台(税务局端)为其办理选择确认

尚未取得的海关进口增值税专用缴款书，转登记纳税人在取得以后，经稽核比对相符的，应当由主管税务机关通过稽核系统为其下载《海关进口增值税专用缴款书稽核结果通知书》;经稽核比对异常的，应当按照现行规定进行核查处理。

需要特别说明的是，用于申报免退税的海关进口后增值税专用缴款书，按照目前的信息系统设置，出口企业用于申报免退税的海关进口增值税专用缴款书，不需要申请进行电子信息稽核比对，应当经主管税务机关查询，确认与海关进口增值税专用缴款书电子信息相符且未被用于抵扣或退税后，才能办理免退税。